Los Biogeógrafos de Latinoamérica prefieren el Software Libre.
Gabriel Gaona
27 de Noviembre de 2017
Introducción
Durante los días del 20 al 24 se desarrolló el Primer Congreso Latinoamericano de Biogeografía. El evento se desarrolló en la ciudad de Tena y concentró a 123 expertos y estudiantes provenientes desde México hasta Argentina y Chile, incluyendo los cientificos europeos investigando en la región. Durante el congreso se llevaron a cabo 8 charlas magistrales , 47 ponencias, 17 póster, 3 talleres, y 1 salida de campo. Una visión más detallada del evento pueden leer en la noticia de Ikiam.
Esta entrada muestra algunos detalles sobre Software y sus Usos en relación a la Biogeografía. Los datos corresponden a evidencias que se presentan en las presentaciones (charlas) y pósters que fueron expuestos durante el Congreso.
¿Por qué es importante conocer sobre el software que usan los Biogeógrafos?
Pueden ser muchas las razones, pero a mi criterio, considero que encontrar una tendencia en cuanto a uso de de los diferentes tipos de software puede proporcionar un campo de especialización para diferentes grupos de profesionales. Por ejemplo, desarrolladores y matemáticos podrían implementar nuevos modelos matemáticos en software de uso común.
Metodología:
Se analizaron todas las ponencias y pósters presentados en el congreso para extraer la información sobre el software y usos del mismo dentro del alcance de cada trabajo. Los datos fueron organizados en una tabla disponible aquí.
suppressPackageStartupMessages(library(tidyverse))
SBG.data <- read_csv("https://docs.google.com/spreadsheets/d/10vxDJ3qxSqax6C8V6YWKNLhfP5DOgfdLYr5Qk3S_nnw/export?format=csv&id=10vxDJ3qxSqax6C8V6YWKNLhfP5DOgfdLYr5Qk3S_nnw&gid=0" ) %>%
arrange(`Tipo software`)
head(SBG.data)## # A tibble: 6 x 10
## Día Orden Tipo Software Uso validación Plataforma
## <int> <int> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr>
## 1 20 1 Charla R Análisis estadístico Reportado Escritorio
## 2 20 1 Charla Maxent Modelamiento espacial Reportado Escritorio
## 3 20 2 Charla R Análisis estadístico Inferido Escritorio
## 4 20 2 Charla Maxent Modelamiento espacial Reportado Escritorio
## 5 20 2 Charla R Análisis estadístico Inferido Escritorio
## 6 20 4 Charla R Gráficos Inferido Escritorio
## # ... with 3 more variables: Licencia <chr>, `Tipo software` <chr>,
## # Accesibilidad <chr>La tabla contiene 10 columnas, donde:
- Las primeras 3 columnas corresponde al “Día” de la ponencia/póster, el “Orden” de las exposisciones en dicho día, y el “Tipo” de trabajo presentado.
- Las 3 siguientes columnas corresponden a la información extraida de cada trabajo: El “Software” utilizado, el “Uso” dentro del trabajo y una etiqueta “Validación”. Esta última columna indica si el software fue explícitamente mencionada o por el contrario no se menciona pero hay evidencia de que se ha usado un software específico.
- Las últimas 4 columnas son los datos del software, consultados en diferentes sitios web. Por “Plataforma” sobre la que trabaja, “Licencia” del software, una categoría del “Tipo de software” y la “Accesibilidad” a dicha herramienta.
Resultados:
No todos los autores mencionan el software utilizado en sus trabajos científicos presentados. Sin embargo, la mayoría al menos muestran indicios de cual software ha sido utilizado. La gráfica de la Fig 1 muestra el porcentaje de registros reportados frente al porcentaje de los inferidos. Estos resultados no incluyen dos ponencias y 3 pósters de los cuales no se obtuvo ningún detalle del software utilizado
A partir de los registros también se halló que 56.2% de las charlas mostraron el empleo de Software Libre en sus tareas, mientras que el Software Privativo se usó en un 43.8 %
Ya con más detalle se puede apreciar en el gráfico siguiente, que el Software Libre más utilizado fue R-Project (esto no incluye las IDE’s o consolas disponibles). Y por el lado del Software Privativo, el más usado fue ArcGIS. En la mayoría de los trabajos no se mencionan las versiones utilizadas de cada uno, por lo tanto no permitió conocer más detalles sobre estas herramientas.
El gráfico anterior también muestra que R-Project es el software más versátil entre los usos de los biogeógrafos. Esto principalmente porque se trata de un entorno de análisis estadístico en el que se aplican las reglas de programación, lo cual lo hace util en diferentes tareas. Al respecto de eso, Llama la atención el caso de Python que al ser un lenguaje de programación propiamente dicho, no fue tan mencionado entre los trabajos científicos presentados. Sin embargo, éste es parte fundamental de otros software aquí discutidos, como: ArcGIS, QGIS, gvSIG, entre otros.
ArcGIS es el software SIS más utilizado en biogeografía, principalmente para tareas de composición cartográfica (“Mapeo”). Los siguientes en orden de uso son: QGIS, DIVA-GIS, gvSIG, Idrisi y SAM.
Definitivamente, Maxent es el software de modelado espacial que más se utiliza. Sin embargo cabe destacar que el algoritmo GARP fue mencionado en una charla, pero exiten varios softwares que implementan este algoritmo. Por lo tanto no fue incluido en este análisis.
El Diagrama de Sankey que se muestra a continuación ilustra las proporciones de registros analizados en este post, clasificados por Validación, Tipo de Licencia y Tipo de trabajo científico. Los porcentajes entre “Charla” y “Poster” no son comparables porque la las muestras no son equivalentes. Sin embargo permite entender la distribución del Software Libre (un poco superior) y el Privativo en cada tipo de trabajo.
Por otro lado, diagrama de Sankey que se muestra a continuación, ilustra el uso de cada software por tipo de trabajo. Aquí se destaca la complejidad que pueden alcanzar los estudios de Biogeografía. Por una parte, diferentes herramientas informáticas para realizar la misma tarea, y por otro, el mismo tipo de tarea fue incluido tanto en las charlas como en los pósters.
Conclusión
El análsis en este artículo no alcanza el panorama completo de la biogeografía en America Latina en terminos de uso de software. A pesar de eso, se puede apreciar la complegidad que pueden alcanzar los estudios en este campo de la ciencia, al demandar la interacción de profesionales de variadas disciplinas.
El software como herramienta informática evoluciona constantemente. Principalmente el software libre ya que es una comunidad mixta de usuarios y desarrolladores quienes proporcionan mejoras de acuerdo a las necesidades colectivas. No es asi con el Software Privativo, cuyo desarrollo y mejoras dependen principalmente de los objetivos del grupo de personas propietarias de la herramienta.
En general, el software libre esta siendo mas utilizado en biogeografía, y aunque la diferencia no es muy superior al privativo, se nota que hay preferencia por este tipo de software. Quizá sea producto del contexto científico en el que el investigador realiza sus tareas, o quizá del contexto latinoamericano en el que se desarrolla la ciencia biogeográfica. Como fuere el caso, la inclinacion hacia el Software Libre esta en el aire!